La historia del municipio de Lourdes está ligada al sacerdote Raimundo Ordóñez Yáñez, considerado fundador de la población. Según la tradición histórica local, durante una visita que realizó a Lourdes, Francia, el sacerdote quedó maravillado por la belleza del lugar y por su significado religioso. Inspirado por aquella experiencia, decidió darle el nombre de Lourdes a la nueva población que ayudaba a fundar.
El 6 de agosto de 1905, el padre Raimundo Ordóñez Yáñez colocó la primera piedra de la iglesia del entonces caserío, fecha considerada tradicionalmente como la fundación de Lourdes.
Inicialmente, la población estuvo relacionada con el nombre de La Concepción.
En 1911 se estableció la parroquia de La Concepción y en 1914 se organizó el corregimiento del mismo nombre, dependiente de Gramalote.
El 29 de abril de 1925, mediante la Ordenanza 44, Lourdes fue creado oficialmente como municipio. El 1 de agosto de 1925 se instaló su primer Concejo Municipal.
El padre Raimundo Ordóñez Yáñez murió el 23 de enero de 1936 y posteriormente sus restos fueron trasladados a Lourdes, donde recibió sepultura solemne.
A lo largo de su historia, Lourdes se ha caracterizado por su producción agrícola, especialmente de café, además de banano, caña panelera, cítricos y otros productos.
Su patrimonio también está ligado a la tradición religiosa, sus paisajes montañosos, cascadas, caminos rurales y al Santuario de Nuestra Señora de Lourdes.
